韩涛 · Tao Han

定位:懂技术、能改进技术的技术使用者与开发者。生物技术本科,三个课题均从实验设计与 SOP 执行做起,覆盖微生物培养鉴定、植物分子实验与组学数据分析;实验记录规范化、可追溯,产物能直接衔接下游统计与自动化报告;已把重复检测环节沉淀为工具并获发明专利受理(第一发明人)。期望在规范化团队中长期发展。
求职意向
🧬分析技术员(生化 / 分子)· 生物信息分析 ◎昆明优先 · 2027.06 毕业
分析技术员(生化岗 / 分子岗)
RNA 提取、反转录、qRT-PCR、毛细管电泳、过表达与 RNAi 载体构建、mRNA 序列设计(委托合成)
分析技术员 · 理化岗
毛细管电泳、微生物 CFU 计数、抑菌圈测量与规范记录
生物信息工程师/生物信息学分析
转录组差异表达、R/Python 统计作图与自动化报告
AI 智能体开发/科研软件
Python 工具开发、重复检测环节自动化与报告生成
实验室助理/科研助理
SOP 执行、无菌操作、实验记录、样本与数据整理
核心成果
专利 · 第一发明人
一种基于卷积神经网络的多算法微生物培养综合识别方法及系统
申请号 202510091154.4 · 实质审查中;覆盖菌落检测、分类计数与抑菌圈测量的完整实验-数据闭环。
植物分子能力
荞麦矮化基因鉴定克隆与载体设计
DWF4 基因鉴定与克隆、表达载体设计构建与遗传转化;组培无菌操作;350 bp RNAi 靶片段与发卡表达盒 in-silico 设计。
论文 · 第四作者
International Journal of Molecular Sciences
27(13):5740,DOI: 10.3390/ijms27135740;CRediT: Software, Data curation。
开源原型
CNN-MicroAI-Colony
菌落检测、分类计数、抑菌圈分析多端原型。
实验技能概览
微生物检测
多种常见菌种分离培养、土壤微生物分离纯化、感受态细胞制作;培养分离、稀释涂布、CFU 计数、抑菌圈测量与形态学鉴别;规范记录菌落形态,完成平板成像与标注。
核酸与分子实验
RNA 提取、反转录、qRT-PCR、毛细管电泳与结果整理;完成过表达与 RNAi 抑制表达载体的构建与遗传转化;mRNA 序列设计(in-silico),合成与制备委托外部公司完成。
无菌操作与记录
培养基制备、高压灭菌、超净台;植物细胞培养(组培):无菌播种与继代管理;按 SOP 执行,保持实验记录规范化、关键步骤可追溯。
数据衔接
R/Python 统计作图与自动化报告;将实验结果整理为可继续分析的表格、图件与记录。
科研与课题经历
微生物培养与智能识别 · 专利课题
研究助理 · 2025.01 — 2026.05
实验设计与操作按 SOP 完成培养基配制与高压蒸汽灭菌、无菌倒平板、四区划线与涂布接种;恒温培养并规范记录菌落形态。
数据与产出标准化平板成像并建立标注数据集,覆盖黏连菌落与低像素难例;Python 脚本辅助批量计数与统计图表;发明专利第一发明人,申请号 202510091154.4,实质审查中。
油菜 YABBY 与柱头发育 · 论文课题
研究助理 · 2025.01 — 2026.05
实验与分析花期取样与表型观察记录;RNA 提取、反转录与 qRT-PCR 上机及结果整理;完成转录组差异表达分析。
成果International Journal of Molecular Sciences, 27(13):5740;DOI: 10.3390/ijms27135740;第四作者,CRediT: Software, Data curation。
荞麦矮化基因挖掘 · 毕业实习课题
科研课题组实习 · 2026.03 — 2026.06
设计与构建完成 DWF4 基因鉴定与克隆、表达载体设计构建与遗传转化;350 bp RNAi 靶片段、发卡表达盒与限制性酶切方案(in-silico),方案文档已归档。
数据与边界DWF4 分析涉及 24 个样本;功能验证待完成。
掌握的方法与仪器
掌握的仪器(按 SOP 独立操作并规范记录)
无菌与培养高压蒸汽灭菌器、超净工作台、恒温培养箱。
检测与量化荧光定量 PCR 仪(上机操作)、毛细管电泳仪、平板成像系统。
核酸分析
RNA 提取 / 反转录 / qRT-PCR按实验方案完成核酸提取、反转录、上机与结果整理。
毛细管电泳完成相关样品的分离检测与结果整理。
微生物检测
菌种分离纯化与鉴别多种常见菌种分离培养、土壤微生物分离纯化、感受态细胞制作;菌落形态记录与鉴别。
CFU 计数 / 抑菌圈稀释涂布 → 恒温培养 → CFU 计数;抑菌圈直径测量。
分子克隆(设计与构建)
基因克隆与载体DWF4 基因鉴定与克隆;过表达与 RNAi 抑制表达载体设计构建(全流程亲手完成);350 bp RNAi 靶片段、发卡表达盒与限制性酶切方案设计。
遗传转化 / mRNA完成遗传转化 / 转基因;mRNA 序列设计(in-silico),合成与制备委托外部公司完成。
无菌操作
培养基与灭菌培养基制备、高压蒸汽灭菌与无菌倒平板。
超净台与细胞培养超净台无菌操作;植物细胞培养(组培):无菌播种与继代管理。
数据分析
R/Python统计作图、结果整理与自动化报告生成。
技术能力 · 工程补充
AI 训练与部署
PP-YOLOE+、PP-YOLO、YOLOv5/v8 训练与微调;ONNX / NCNN 导出与边缘推理;完成树莓派 5 同机对比。
生物信息学分析
RNA-seq 差异表达、BLASTP/RBH、DESeq2、WGCNA、GSEA/Mfuzz、系统发育分析;使用 AlphaFold 完成候选蛋白结构预测,辅助功能位点解释,整理可复现图件。
系统与环境
Linux、Git、Docker;发起 Linxira OS 科研工作站,维护签名仓库、容器化科研复现与软件目录。
自动化工程
TypeScript/Bun 开发 OpenCode 科研编排插件与 API 网关原型,支持权限、计划、检查点与多端接入。
开源项目与模型训练部署
Linxira Bio SDK本地优先生信分析平台;Rust 引擎、GUI/CLI、112 个分析能力与 35 个 skills,中英双语文档;可复现性基准公开:salmon TPM r=1.000000(linxira-os.github.io 官方博客)。
Linxira Zeta终端 AI 编码代理;支持 TUI、Print/JSON、RPC、SDK,多端会话与 15+ 模型提供商。
Linxira OS面向科研工作站的 Arch 系发行版,已发布实验性正式版 ISO(4.79 GB,SHA256 校验);签名仓库、17 个自研工具与容器化复现。
模型训练与部署围绕 PP-YOLO 系列开展训练、学习率策略比较、ONNX/NCNN 推理;基于昇腾 NPU + MindSpore 完成开源 LLM 训练/微调任务跑通,评测整理中。
openagent-labforge-bioOpenCode 科研编排插件;权限分层、计划执行、续跑/审查、会话检查点;19 个自研 Agent 定义,按需索引 617 个生态生信技能(87 类)。
Buckwheat-seed-quality / CNN-MicroAI-Colony荞麦籽粒检测与菌落分析多端实践;树莓派 5 测试 NCNN 307 ms、ONNX Runtime 561 ms,菌落检测小样本测试 2539 ms 降至 1884 ms。
可独立承担的检测任务
菌落总数检测样品稀释涂布 → 恒温培养 → CFU 平板计数与记录。
抑菌圈测量药敏平板制备与接种,抑菌圈直径测量与复核(抑菌活性测定)。
核酸提取与 qRT-PCRRNA 提取、反转录、上机与结果整理,衔接下游分析。
毛细管电泳检测样品分离检测与结果整理,配合规范化记录。
实验数据与下游分析
转录组数据RNA-seq 差异表达分析与可复现脚本整理。
菌落图像数据标注数据集(统一判读口径、跨批次一致)→ CNN 检测、分类与计数。
分子验证数据qRT-PCR 结果整理与表达模式归纳,衔接表型观察记录。
统计与报告R/Python 统计与可视化,自动化报告生成,实验数据全程可追溯。